全自動在線分析儀通過對電磁閥組的控制，分別將蠕動泵1、蠕動泵2輸送來釋放液和水樣進行間隔混合，使其迅速反應，將氨離子轉化為游離態的氨，反應后的溶液經過氣液分離器時，釋放出氨氣，氨氣透過氣液分離膜后被吸收液吸收，從而使吸收液的顏色發生變化。經過必要的富集后，吸收液進入流通池，通過分光光度法定量，測得水樣中的氨氮含量。
在使用中會遇到許多非常復雜的環境，因此分析儀器的各部零件很容易出現問題，尤其是一些系統中的控制和傳感部件。例如很多人日常不會在意的閥門，閥門作為控制系統中常用的零件，它主要的作用是截止、調節、導流、分流和穩壓泄壓等功能，雖然不起眼但也是非常重要的，閥門的工作狀態將直接影響到檢測結果。因此在日常的儀器維護中應多加注意。
全自動在線分析儀閥門的維護原則如下：
1.定期檢查水質在線分析儀器閥門的密封面、閥桿等有無磨損，若有損壞失效要及時進行修理或更換，對于明桿閥門要記住全開或全關是閥桿的位置，避免在打開時撞擊死點，便于檢查在全閉時是否出現閥板脫落、密封面是否占有雜物等問題。
2.保持閥門外部和活動部位的清潔，如果是室外環境要保護好閥門油漆的完整，表面容易沉積灰塵、介質殘留等地方要定期的維護清理，避免因腐蝕而產生的部件損壞。
3.要水質在線儀器閥門的齊全與完好，不允許出現松動的現象，如果是手工安裝或更換新的閥門時力度要適中，避免因為旋轉力度過多造成閥門的損壞，另外閥門的緊固螺絲如出現松動要及時擰緊，手輪丟失后要及時進行更換，不允許用其他物品代替的情況發生。
